М.С. Вонский1, 2, А.Л. Рунов1, 2
1 ФГУП «ВНИИМ им. Д.И. Менделеева», Санкт-Петербург, Россия,
2 ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова», Санкт-Петербург, Россия
m.s.vonsky@vniim.ru
«Альманах современной метрологии» № 1 (33) 2023, стр. 107–112
УДК 681.5.08
Аннотация. Измерения нуклеиновых кислот составляют значительную часть аналитических процедур, выполняемых в лабораториях самой разной специализации, включая научные лаборатории, работающие в области биологии, клинико-диагностические лаборатории, судебно-медицинские лаборатории, ветеринарные лаборатории и лаборатории биотехнологических производств. Особенности этих измерений во многом определяются своеобразием определений измеряемой в них величины и аналита. Количественная полимеразная цепная реакция (кПЦР), обычно применяемая в лабораториях для выполнения измерений, представляет собой относительный метод, требующий использования внешнего калибратора, значения содержания целевой последовательности ДНК в котором должны быть прослеживаемы до соответствующего стандартного образца. Прямые измерения содержания последовательности нуклеотидов стали возможны с внедрением метода цифровой ПЦР (цПЦР). Обеспечение точности, международной сопоставимости измерений нуклеиновых кислот, прослеживаемости их результатов к единицам системы SI является задачей Рабочей группы по анализу нуклеиновых кислот Консультативного комитета по количеству вещества (метрология в химии и биологии) Международного бюро мер и весов (РГНА КККВ МБМВ). В ряде ключевых и пилотных сличений, проведенных РГНА под эгидой КККВ, было продемонстрировано, что применение цПЦР позволяет обеспечить сопоставимость результатов измерений лабораториями национальных метрологических институтов концентрации копий последовательности нуклеотидов и отношения числа копий последовательностей нуклеотидов.
Ключевые слова: нуклеиновая кислота, единица величины, число копий последовательности, цифровая ПЦР, прослеживаемость.
Цитируемая литература
1. International Vocabulary of Metrology — Basic and General Concepts and Associated Terms (VIM) 3rd Edition // JCGM. — 2012. — https://www.bipm.org/en/ publications/guides.
2. Nordin G. et al., Vocabulary on nominal property, examination, and related concepts for clinical laboratory sciences (IFCC-IUPAC Recommendations 2017) // Pure and Applied Chemistry. — 2018. — V. 90.
3. O’Leary N. et al. // Nucleic Acids Res. — 2016. — V. 44 (D1). — Р. D733–745.
4. Andrews R. et al. // Nat. Genet. — 1999. — V. 23. — P. 147.
5. Homo sapiens mitochondrion, complete genome, NCBI Reference Sequence: NC_012920.1. — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/NC_012920.1, Retrieved 03 November 2021.
6. The International System of Units (SI), 2019. — https://www.bipm.org/en/ measurement-units.
7. Piovesan A. et al. // BMC Research Notes. — 2019. — V. 12 (1). — P. 106.
8. Matniyazov R. et al. // Biomics. — 2014. — V. 6 (3). — P. 155–166.
9. Roberto M. et al. // Pure Appl. Chem. — 2018. — V. 90 (1). – P. 175–180.
10. On the revision of the International System of Units — International Union of Pure and Applied Chemistry, IUPAC, International Union of Pure and Applied Chemistry, 16 November 2018, Retrieved 03 November 2021.
11. Kaczmarczyk A., Bowra S., Elek Z., Vincze E. // BMC Plant Biol. — 2012. — V. 12. — P. 184.
12. Fryer J., Heath A., Wilkinson D., Minor P. // Biologicals. — 2017. — V. 46. — P. 57–63.
13. Ruijter J. et al. Efficiency-correction is required for accurate qPCR analysis and reporting // Clinical chemistry. — 2021. — V. 67.
14. Mester Z. et al. // Metrologia. — 2020. — V. 57 (1A). — P. 0804.
15. Milton M., Quinn T. // Metrologia. — 2001. — V. 38. — P. 289.
16. National Measurement Institutes demonstrate high accuracy reference measure-ment system for SARS-CoV-2 testing. — https://www.bipm.org/en/-/2020-nmi-covid, Retrieved 03 November 2021.
Статья поступила в редакцию: 13.12.2022 г.
Статья прошла рецензирование: 19.09.2022 г.
Статья принята в работу: 23.01.2023 г.
Статья в полном объеме в Научной электронной библиотеке eLIBRARY.
Оформить подписку и купить печатные номера журнала у издателя.